Allgemein hilft bei sowas immer gern das
Yes-Command.
In deinem Fall ist es aber nicht rsync, sondern das von ihm benutzte SSH, welches deine Zustimmung verlangt. Dagegen helfen die SSH-Optionen
-o UserKnownHostsFile=/dev/null und -o StrictHostKeyChecking=no.
Wenn du generell nicht mit known_hosts arbeitest, kannst du diese Settings auch in deiner ~/.ssh/config setzen.